サービス概要

メタゲノム解析（16S rRNA 領域の細菌叢解析）は、バクテリアの 16S rRNA 領域(V3-V4) を増幅・シーケンスを行い、ASV解析を行っております。
細菌叢解析では、微生物の分離・培養を経ずに、微生物の集団の状態でシーケンスを行いますので、多検体の処理も可能であり、また、従来の方法では困難であった難培養性の微生物の情報も取得することが可能です。ヒト腸内細菌叢、土壌中の微生物集団の解析などに利用をされています。

※真菌の 18s rRNA 配列（ITS領域）を利用した真菌叢解析の実施も可能です（細菌と真菌を同時に解析することはできません。）。
※アンプリコンシーケンスとしてサービスを応用して利用をすることも可能です。

アプリケーション例

抽出したDNAのご提供を受け、バクテリアの 16S rRNA 領域(V3-V4) をPCRにより増幅してライブラリを調製し、
MiSeq, 300bp, Paired endで１サンプル当たり10万リード程度のシーケンスを行います。

代表的な仕様

• ライブラリ調製：16S rRNA(V3-V4) 1stPCRから
• シーケンス条件：MiSeq, 300bp, Paired end, 10万 Reads/sample
• データ解析　　：ASV解析

※ASV解析: Amplicon Sequence Variant解析。細菌叢から得られた16S rRNA遺伝子由来のリード配列について、
　設定した類似度（通常97%以上）を基準としてクラスターに分類し、各クラスターから代表配列をBLAST検索し、属種名を同定します。

納期

シーケンスのみご依頼の場合：サンプル受領から約 4-6 週間
データ解析までご依頼の場合：サンプル受領から約 8 週間

サンプル受領のタイミングや取得したデータによっては、納期が前後する場合がありますので、ご了承ください。

ご依頼の流れ

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FAQ

品質チェックや納品物に関するよくあるご質問については、こちらをご覧ください。

お問い合わせ先

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